Biaya Pendidikan bagi mahasiswa STAI Sufyan Tsauri Majenang Cilacap tergolong murah dibandingkan perguruan tinggi swasta lainnya, adapun rincian biayanya yakni;

A. Biaya Persemester

    1. Registrasi                                     150.000,-
    2. Kemahasiswaan                           150.000,-
    3. SKS/Semester                              800.000,-
    4. SPP/Semester                              850.000,-

               Jumlah                                       1.950.000,-

B. Biaya yang harus dibayar pada semester 1

  1. Pengembangan Kampus                    1.500.000,-
  2. Kartu Mahasiswa, NIRM & Perpus        150.000,-
  3. PBAK                                                      250.000,-
  4. Sumbangan Perpustakaan                    100.000,-
  5. Jas Almamater                                       200.000,-

  Jumlah                                                      2.200.000,-