Biaya Pendidikan bagi mahasiswa STAI Sufyan Tsauri Majenang Cilacap tergolong biaya murah dibandingkan perguruan tinggi swasta lainnya, adapun rincian biayanya yakni;

A. Biaya Persemester

    1. Registrasi                 150.000,-
    2. Kemahasiswaan       100.000,-
    3. SKS/Semester          700.000,-
    4. SPP/Semester          750.000,-

               Jumlah                          1.700.000,-

B. Biaya yang harus dibayar pada semester 1

  1. Pengembangan Kampus                    1.500.000,-
  2. Kartu Mahasiswa, NIRM & Perpus        150.000,-
  3. Ospek                                                    250.000,-
  4. Sumbangan Perpustakaan                    100.000,-
  5. Jas Almamater                                       200.000,-

  Jumlah                                                      2.200.000,-